تدور أحداث هذا الجزء بعد خمس سنوات نهاية الجزء الأول، حين كشف الأبطال أسرار الـEridian Vault، أتى رجل يدعى Jack الوسيم ليأخذ كل الثناء من الأبطال وإستولى على الثروات التي كانت موجودة في الخزنة، وبسببها إستولى على شركات Hyperion ويتحكم من خلالها بكوكب Pandora، وبدأ من هنا بحملتة لتنظيف الكوكب من السكان ليحوله إلى كوكب صناعي، وعلى الأبطال بالطبع إيقاف مخططاته الشريرة.