مجموعة Metal Gear Solid HD Collection احتوت الجزء الثاني والثالث من السلسلة بالإضافة لـPeace Walker بالتعريف العالي. سئل الاستوديو من قبل أحد المعجبين عن سبب عدم إرفاق Metal Gear Solid: Twin Snakes التي صدرت على الـGame Cube للمجموعة كذلك، وكان هذا ردّهم:
اللعبة طوّرت تحت استوديو Silicon Knights. نحن أشرفنا على المشروع ولكننا لم نعمل عليه بأنفسنا، وأردنا التأكد من أن جميع ما أرفق في الـHD Collection كان من صنعنا نحن. كل ما هو موجود في المجموعة طوّر مباشرة تحت استوديوات Kojima Productions وتحت Kojima بنفسه. هذا هو سبب عدم إرفاق Twin Snakes في مجموعة HD Collection.